O programa São José Universitária foi criado com o objetivo de promover a ampliação das oportunidades de ensino superior público e gratuito para a população de São José dos Campos, para fortalecer os sistemas de formação e qualificação profissional com vistas ao desenvolvimento da cidade e apoiar as atividades de pesquisa e extensão universitária.

Entre as ações desenvolvidas, estão as parcerias com o Governo Federal e instituições públicas estaduais e federais de educação nos níveis técnico, superior e tecnológico para a criação de cursos e unidades de ensino no município.

Em parceria com o Centro Paula Souza, do Governo de São Paulo, foram instituídas a Escola Técnica (Etec) e a Faculdade de Tecnologia (Fatec).

Com o Governo Federal, foi instalada na cidade uma unidade da Universidade Federal de São Paulo (Unifesp) e introduzida a modalidade de educação superior a distância, por meio do Sistema Universidade Aberta do Brasil/MEC, em parceria com a Universidade Federal de Ouro Preto (Ufop), Universidade Federal de São Carlos (UFSCar), Universidade Federal Tecnológica do Paraná (UFTPr), Universidade Federal do ABC (UFABC) e Universidade Federal de São Paulo (Unifesp).