São José dos Campos é um dos maiores centros de referência em ciência e tecnologia da América Latina e polo de formação de recursos humanos de alto nível em áreas avançadas, como as de aeronáutica e espaço, meteorologia, materiais compostos e telecomunicações.

As empresas e os projetos nascentes têm também o apoio de quatro incubadoras: uma instalada no Parque Tecnológico e coordenada pelo Cecompi; a Incubaero, no DCTA; outra na Revap/Petrobras; e a da Universidade do Vale do Paraíba (Univap), que tem capacidade para 40 empresas inovadoras nas áreas de áreas de materiais, eletrônica, telecomunicações, tecnologia de informação, aeroespacial, energia, meio ambiente, biotecnologia, bioinformática, química fina e softwares.

Alguns dos centros de pesquisas estão no Departamento de Ciência e Tecnologia Aeroespacial (DCTA), do Governo Federal, ou no entorno.

• Instituto Tecnológico de Aeronáutica (ITA): graduação em engenharias
• Instituto de Aeronáutica e Espaço (IAE): projetos nos setores aeronáutico, aeroespacial e de defesa, corresponsável pela realização do Programa Espacial Brasileiro
• Instituto de Estudos Avançados (IEAv): ciência pura e aplicada em laser, óptica e sistemas aeroespaciais
• Instituto de Fomento e Coordenação Industrial (IFI): responsável pela homologação aeronáutica civil e militar e projetos de transferência de tecnologia à indústria

Ainda no campo das ciências e tecnologias espaciais, está sediado na cidade o Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (Inpe), também do Governo Federal, responsável pelo Programa Espacial Brasileiro, por programas de cooperação com os maiores centros de pesquisa mundiais em aplicações de satélites meteorológicos, de sensoriamento remoto de recursos naturais, monitoramento de florestas, mudanças climáticas globais, desenvolvimento de plataformas espaciais e cargas úteis de aplicação civil.

Várias universidades e faculdades formam milhares de profissionais por ano, sendo três instituições de ensino público e gratuito.

• Universidade Federal de São Paulo (Unifesp)
• Faculdade de Tecnologia (Fatec)
• Universidade Estadual de São Paulo (Unesp), com a faculdade de odontologia
• Universidade do Vale do Paraíba (Univap)
• Universidade Paulista (Unip)
• Faculdades Etep
• Anhanguera Educacional
• Fundação Armando Álvares Penteado (Faap), com cursos de especialização e pós-graduação
• Instituto de Filosofia Santa Terezinha

O ensino profissionalizante dispõe de nove escolas técnicas, que oferecem cursos em diversas modalidades requisitadas pelo mercado.