O parque industrial de São José dos Campos tem 1.450 indústrias e emprega aproximadamente 38 mil pessoas (2010), sobressaindo-se no cenário nacional pelo forte desempenho nos seguintes setores e respectivas cadeias produtivas: aeronáutica, automotivo, telecomunicações, espacial, de defesa, químico-farmacêutico e de petróleo e gás.

Entre as empresas locais, destaca-se a Embraer, uma das maiores exportadoras do Brasil, terceira fabricante de aviões comerciais no mundo e líder no segmento de aviação regional. A nacionalização da produção da empresa tende a crescer à medida que mais fornecedores internacionais instalam-se na região, como ocorreu com a Pilkington Aerospace (britânica), Sobraer/Sonaca (belga), Aernnova (espanhola) e SK-10 (espanhola).

O consórcio High Technology Aeronautics (HTA), formado por pequenas e médias empresas, reúne exportadoras de aeropeças, fornecedoras da Embraer e da espanhola EADS-Casa.

O município tem ainda outras grandes empresas, como Petrobras - com a Refinaria Henrique Lage (Revap), General Motors, Monsanto, Ericsson, Johnson & Johnson, Panasonic, J. Macedo, Gerdau Hitachi, Johnson Controls, TI Automotive, Eaton, Parker Hannifin, Trelleborg, VSE, Orion, Heatcraft, BBA Bidim, Crylor, Radici Fibras. No distrito empresarial das Chácaras Reunidas, concentram-se empresas de pequeno e médio portes, que, na maioria, são fornecedoras de peças e equipamentos para grandes indústrias locais.